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Las muestras se muelen bajo nitrógeno líquido seguido de una incubación en la solución de lisis que inactiva inmediatamente las RNasas y crea las condiciones de unión correctas para la absorción del ARN en la membrana de sílice. Junto con la solución de lisis, se agrega una solución de PVP (polivinilpirrolidona), que actúa uniendo los agentes contaminantes, como los polisacáridos y los polifenoles, que pueden interferir o degradar el ARN.
Los metabolitos como la sal y los componentes celulares se eliminan mediante el lavado con 2 tampones diferentes. El ARN total se eluye con agua libre de nucleasas.
PLANT RNA Kit contiene 2 soluciones de lisis diferentes, una basada en tiocianato de guanidina, la más recomendada debido a su alta propiedad de desnaturalización, y otra basada en el clorhidrato de guanidina, ya que en algunas plantas y hongos la presencia de ciertos metabolitos produce una solidificación del lisado.
