Un tampón especialmente formulado permite que el ADN circulante se una a las columnas MicroSpin. Las muestras se lisan en condiciones de desnaturalización y luego se transfieren a la columna de ADN donde el ADN circulante se une y los restos celulares, la hemoglobina y otras proteínas se eliminan por lavado. El ADN de alta calidad se eluye en agua libre de nucleasas. Normalmente, el ADN circulante está muy fragmentado 50-1000 pb. El grado de fragmentación depende de varios parámetros, como el origen del ADN (ADN fetal, tumoral, microbiano), el donante de sangre de la salud, el procedimiento de recolección de sangre, la manipulación y el almacenamiento de la muestra.